失落的方舟女王城有两个，分别是位于贝隆大陆北部的贝隆城（VernCastle）和洛恒戴尔大陆的洛亚伦（Lorain）。贝隆城是人类女王艾琳（Ealyn）的主城，洛亚伦则是精灵女王伊南娜的都城。
贝隆城坐落于贝隆大陆北部，是贝隆王国的首都，也是玩家中后期核心活动区域之一。从伯尔尼港口登陆后，沿主干道向北直行即可抵达。整座城市以灰白色调的哥特式建筑为主，中央矗立着巨大的女王城堡，内部设有王座大厅、元老院和皇家交易所。这里是开启混沌地牢、星辰护卫等终局玩法的关键节点，也是玩家获取50级后觉醒任务的重要地点。
洛亚伦位于洛恒戴尔大陆世界树埃尔乔文的枝干之上，是精灵女王伊南娜的居所，也是洛恒戴尔的首都。这座城市被粉色樱花与翠绿植被覆盖，建筑风格轻盈灵动，充满自然魔法气息。玩家完成洛恒戴尔主线任务后可解锁此区域，城内不仅有精灵女王的宫殿，还有魔力核实验室与古老的精灵图书馆，是推进二觉任务和剧情的重要场所。
贝隆城与洛亚伦均为重要社交与功能枢纽。贝隆城的皇家交易所可进行高级材料交易，元老院区域可接取阵营任务；洛亚伦的世界树广场是玩家传送与组队的集合点，女王宫殿旁的邮箱可触发二觉起始任务“一封奇异的邮件”。两座城市都设有传送阵、拍卖行与福利商人，是玩家日常活跃的核心区域。
快速前往女王城的方法：完成主线解锁对应大陆后，使用F2演奏“特里希温之歌”可快速传送到贝隆城门口；完成洛恒戴尔主线后，通过世界树传送阵直达洛亚伦。玩家可在任意主城的“世界地图”界面，选择贝隆或洛恒戴尔区域，点击对应城市图标进行远程传送，消耗少量银币即可快速抵达。
