蜂后是巨大蜂巢的守护者，击杀它可以获得蜂王浆等珍贵资源。需要做好充分准备才能挑战，还需要准备控制道具，冰封法杖需要五次施法才能冻住目标，催眠吹箭需要五发才能睡眠目标。清理野生蜂巢聚集地可以收集蜂巢和活蜜蜂，用于制作蜂箱提供蜂蜜来源，最少带四个活蜜蜂用于解锁科技。一种高效方法是卡墙法，对地形有要求需要靠近地图边缘。建造一长排栅栏，设置冷热篝火应对昼夜变化。招惹蜂后时小心靠近，然后拉到地形边缘。
蜂后是飞行单位可以飞过栅栏，但蜜蜂护卫需要绕道而行，这样可以专注于攻击蜂后避开护卫干扰。多人合作时这个方法更高效，可以快速击杀蜂后。蜂后开始时召唤四到五只护卫蜜蜂跟随攻击，靠近时用毒针造成六十点伤害，穿戴养蜂帽可以减少伤害。蜂后移动时滴落蜂蜜踩到会减速，蜂蜜一段时间后自动消散。生命值减少后蜂后召唤更多护卫最多达到八只，并尖叫提高护卫攻击速度，使战斗后期更困难。
另一个方法是触手打法，适合图书管理员角色。在巨大蜂巢附近建造草墙或石墙，攻击墙至低血量便于行走。在墙上使用在触手之上书，这本书需要莎草纸和触手皮制作，材料可以在沼泽地获得。使用后附近生成大量触手，勾引蜂后进入触手区域，触手自动攻击蜂后。
这种方法需要管理精神值，因为触手存在会降低精神，但掉落物丰富包括触手皮补充损耗。战斗中要注意装备耐久，准备多个木甲备用。要是精神值过低，可以用矮人之星回复，但梦魇也会出现干扰。攻击时保持移动避免被蜂蜜减速和护卫围攻，击杀蜂后掉落蜂后王冠和蜂王浆，蜂王浆可以与蜂蜜制作糖豆，在锅中烹饪能补满生命值非常有用。
