口袋妖怪火红中，核心船票（圣安奴号船票）在华蓝市东北方向25号道路尽头的正辉家，帮助正辉恢复人形后即可获得；二周目三岛通行船券在一之岛宝可梦网络中心由锦辉赠送，神秘船票与极光票则由二周目剧情与特定活动解锁。
获取圣安奴号船票是推进关都主线的关键一步，前置条件是击败华蓝市道馆馆主小霞并拿到蓝色徽章，解锁24号道路通行权限。从华蓝市北侧出口出发，进入24号道路，沿途有多位训练家拦路，全部击败后抵达道路尽头的小桥，过桥后进入25号道路。25号道路为线性路线，无复杂岔路，一路向北直行至道路最北端，能看到一栋孤立的海边小屋，这就是正辉的住所。进入屋内，会发现一只粉色皮皮，对话后可知其是实验事故变形的正辉，选择协助他，随后操作屋内的电脑装置，触发恢复程序，正辉变回人形后会赠予圣安奴号船票。
圣安奴号船票的核心用途是前往枯叶市港口，登上圣安奴号游轮，船上不仅有大量训练家可对战刷级，还能在船长室帮船长按摩后获得秘传机01居合斩，为后续探索岩石隧道等区域扫清障碍。需注意该船票为一次性道具，登船后游轮会离港，错过则需重新触发正辉剧情才能再次获取登船权限。枯叶市港口除圣安奴号外，后续解锁七岛后可乘坐海烈焰马号前往一之岛，推进二周目剧情。
二周目所需的三岛通行船券，需先完成关都主线、击败四天王，再集齐60种以上宝可梦，找大木博士升级全国图鉴。随后前往枯叶市港口乘船抵达一之岛，进入岛上的宝可梦网络中心，与锦辉对话即可获得，凭此可自由往返一之岛、二之岛、三之岛。解锁全部七岛则需完成火箭队相关任务，收集红宝石、蓝宝石后兑换彩虹通行证，开启四至七岛的探索，这些岛屿藏有不少稀有宝可梦与神兽捕捉剧情。
除常规船票外，游戏中还有神秘船票与极光票，前者用于前往肚脐岩捕捉凤王与洛奇亚，后者用于前往诞生之岛捕捉代欧奇希斯。这两张特殊船票需完成二周目全部前置任务，包括解锁全国图鉴、完成七岛主线、击败火箭队关键成员后，通过剧情触发或特定活动获取，是收集全神兽的核心道具。集齐所有船票后，可完整探索关都地区与七岛区域，完成图鉴收集与全神兽捕捉的终极目标。
